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公開番号2025128367
公報種別公開特許公報(A)
公開日2025-09-02
出願番号2025102078,2023205753
出願日2025-06-18,2015-06-12
発明の名称乳がんの検出キット又はデバイス及び検出方法
出願人東レ株式会社,国立研究開発法人国立がん研究センター
代理人弁理士法人平木国際特許事務所
主分類C12Q 1/6886 20180101AFI20250826BHJP(生化学;ビール;酒精;ぶどう酒;酢;微生物学;酵素学;突然変異または遺伝子工学)
要約【課題】乳がんの検出用キット又はデバイス、並びに、検出方法を提供する。
【解決手段】被験体の検体中のmiRNAと特異的に結合可能な核酸を含む、乳がん検出
用キット又はデバイス、並びに、該miRNAをin vitroで測定することを含む
、乳がんを検出する方法。
【選択図】なし
特許請求の範囲【請求項1】
乳がんマーカーである、miR-1233-5pと特異的に結合可能な核酸を含む、乳がんの検出用キット。
続きを表示(約 9,700 文字)【請求項2】
前記核酸が、
下記の(1)~(5)のいずれかに示すポリヌクレオチド又はその断片:
(1)配列番号20で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(2)(1)のポリヌクレオチド又はその断片の塩基配列において1又は2の塩基の欠失、置換、付加又は挿入を含むポリヌクレオチド又はその断片、
(3)修飾核酸及び/又は修飾ヌクレオチドを含む(1)又は(2)のポリヌクレオチド又はその断片、
(4)配列番号20で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(5)下記の(a)~(d)のいずれかのポリヌクレオチド又はその断片とハイストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
(a)配列番号20で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(b)(a)のポリヌクレオチド又はその断片の塩基配列において1又は2の塩基の欠失、置換、付加又は挿入を含むポリヌクレオチド又はその断片、
(c)修飾核酸及び/又は修飾ヌクレオチドを含む(a)又は(b)のポリヌクレオチド又はその断片、及び
(d)配列番号20で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列を含むポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
からなる群から選択される、請求項1に記載のキット。
【請求項3】
前記キットが、別の乳がんマーカーである、miR-4783-3p、miR-1307-3p、miR-4634、miR-663a、miR-4532、miR-7704、miR-3178、miR-6729-5p、miR-6090、miR-4732-5p、miR-3184-5p、miR-6727-5p、miR-6088、miR-4674、miR-8073、miR-4787-5p、miR-1469、miR-125a-3p、miR-885-3p、miR-6802-5p、miR-328-5p、miR-6787-5p、miR-8069、miR-6875-5p、miR-1246、miR-4734、miR-6756-5p、miR-3665、miR-6821-5p、miR-6805-5p、miR-4728-5p、miR-6726-5p、miR-197-5p、miR-149-3p、miR-6850-5p、miR-4476、miR-6858-5p、miR-564、miR-4763-3p、miR-575、miR-6771-5p、miR-1231、miR-1908-3p、miR-150-3p、miR-3937、miR-887-3p、miR-3940-5p、miR-4741、miR-6808-5p、miR-6869-5p、miR-5090、miR-615-5p、miR-8072、miR-128-1-5p、miR-1238-5p、miR-365a-5p、miR-204-3p、miR-4492、miR-6785-5p、miR-6511a-5p、miR-4525、miR-1915-5p、miR-3180、miR-6879-5p、miR-1199-5p、miR-6746-5p、miR-711、miR-663b、miR-4707-3p、miR-6893-5p、miR-4675、miR-4638-5p、miR-4651、miR-6087、miR-4665-5p、miR-4758-5p、miR-6887-5p、miR-3620-5p、miR-1909-3p、miR-7641、miR-6724-5p、miR-1343-3p、miR-6780b-5p、miR-4484、miR-4690-5p、miR-4429、miR-1227-5p、miR-4725-3p、miR-6861-5p、miR-6812-5p、miR-3197、miR-8059、miR-3185、miR-4706、miR-4497、miR-3131、miR-6806-5p、miR-187-5p、miR-3180-3p、miR-6848-5p、miR-6820-5p、miR-6800-5p、miR-6717-5p、miR-6795-5p、miR-4632-5p、miR-6778-5p、miR-3663-3p、miR-4689、miR-211-3p、miR-6511b-5p、miR-4750-5p、miR-6126、miR-614、miR-7110-5p、miR-744-5p、miR-6769a-5p、miR-4792、miR-5787、miR-6798-5p、miR-6781-5p、miR-4419b、miR-4446-3p、miR-4259、miR-5572、miR-6075、miR-296-3p、miR-6891-5p、miR-4745-5p、miR-6775-5p、miR-6870-5p、miR-920、miR-4530、miR-6819-5p、miR-6825-5p、miR-7847-3p、miR-6131、miR-4433-3p、miR-1228-5p、miR-6743-5p、miR-1268a、miR-3917、miR-6786-5p、miR-3154、miR-638、miR-6741-5p、miR-6889-5p、miR-6840-3p、miR-6510-5p、miR-3188、miR-551b-5p、miR-5001-5p、miR-1268b、miR-7107-5p、miR-6824-5p、miR-6732-5p、miR-371a-5p、miR-6794-5p、miR-6779-5p、miR-4271、miR-5195-3p、miR-6762-5p、miR-939-5p、miR-1247-3p、miR-6777-5p、miR-6722-3p、miR-3656、miR-4688、miR-3195、miR-6766-5p、miR-4447、miR-4656、miR-7108-5p、miR-3191-3p、miR-1273g-3p、miR-4463、miR-2861、miR-3196、miR-6877-5p、miR-3679-5p、miR-4442、miR-6789-5p、miR-6782-5p、miR-486-3p、miR-6085、miR-4746-3p、miR-619-5p、miR-937-5p、miR-6803-5p、miR-4298、miR-4454、miR-4459、miR-7150、miR-6880-5p、miR-4449、miR-8063、miR-4695-5p、miR-6132、miR-6829-5p、miR-4486、miR-6805-3p、miR-6826-5p、miR-4508、miR-1343-5p、miR-7114-5p、miR-3622a-5p、miR-6765-5p、miR-7845-5p、miR-3960、miR-6749-5p、miR-1260b、miR-6799-5p、miR-4723-5p、miR-6784-5p、miR-5100、miR-6769b-5p、miR-1207-5p、miR-642a-3p、miR-4505、miR-4270、miR-6721-5p、miR-7111-5p、miR-6791-5p、miR-7109-5p、miR-4258、miR-6515-3p、miR-6851-5p、miR-6125、miR-4749-5p、miR-4726-5p、miR-4513、miR-6089、miR-6816-5p、miR-4466、miR-4488、miR-6752-5p、miR-4739、miR-760、miR-602、miR-423-5p、miR-92a-2-5p、miR-16-5p、miR-451a、miR-135a-3p、miR-486-5p、miR-4257、miR-92b-5p、miR-1915-3p、miR-718、miR-940、miR-296-5p、miR-23b-3p、miR-92a-3p、miR-658、miR-6842-5p、miR-6124、miR-6765-3p、miR-7106-5p、miR-4534、miR-92b-3p、miR-3135b、miR-4687-3p、miR-762、miR-3619-3p、miR-4467、miR-557、miR-1237-5p、miR-1908-5p、miR-4286、miR-6885-5p及びmiR-6763-5pからなる群から選択される少なくとも1つのポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸をさらに含む、請求項1又は2に記載のキット。
【請求項4】
前記核酸が、下記の(6)~(10)のいずれかに示すポリヌクレオチド又はその断片:
(6)配列番号1、3~19、21~28、30、31、33~109、111~235、851~856、及び236~269のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(7)(6)のポリヌクレオチド又はその断片の塩基配列において1又は2の塩基の欠失、置換、付加又は挿入を含むポリヌクレオチド又はその断片、
(8)修飾核酸及び/又は修飾ヌクレオチドを含む(6)又は(7)のポリヌクレオチド又はその断片、
(9)配列番号1、3~19、21~28、30、31、33~109、111~235、851~856、及び236~269のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(10)下記の(e)~(h)のいずれかのポリヌクレオチド又はその断片とハイストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
(e)配列番号1、3~19、21~28、30、31、33~109、111~235、851~856、及び236~269のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(f)(e)のポリヌクレオチド又はその断片の塩基配列において1又は2の塩基の欠失、置換、付加又は挿入を含むポリヌクレオチド又はその断片、
(g)修飾核酸及び/又は修飾ヌクレオチドを含む(e)又は(f)のポリヌクレオチド又はその断片、及び
(h)配列番号1、3~19、21~28、30、31、33~109、111~235、851~856、及び236~269のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列を含むポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片
からなる群から選択される、請求項3に記載のキット。
【請求項5】
乳がんマーカーである、miR-1233-5pと特異的に結合可能な核酸を含む、乳がんの検出用デバイス。
【請求項6】
前記核酸が、
下記の(1)~(5)のいずれかに示すポリヌクレオチド又はその断片:
(1)配列番号20で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(2)(1)のポリヌクレオチド又はその断片の塩基配列において1又は2の塩基の欠失、置換、付加又は挿入を含むポリヌクレオチド又はその断片、
(3)修飾核酸及び/又は修飾ヌクレオチドを含む(1)又は(2)のポリヌクレオチド又はその断片、
(4)配列番号20で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(5)下記の(a)~(d)のいずれかのポリヌクレオチド又はその断片とハイストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
(a)配列番号20で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(b)(a)のポリヌクレオチド又はその断片の塩基配列において1又は2の塩基の欠失、置換、付加又は挿入を含むポリヌクレオチド又はその断片、
(c)修飾核酸及び/又は修飾ヌクレオチドを含む(a)又は(b)のポリヌクレオチド又はその断片、及び
(d)配列番号20で表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列を含むポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
からなる群から選択される、請求項5に記載のデバイス。
【請求項7】
前記デバイスが、別の乳がんマーカーである、miR-4783-3p、miR-1307-3p、miR-4634、miR-663a、miR-4532、miR-7704、miR-3178、miR-6729-5p、miR-6090、miR-4732-5p、miR-3184-5p、miR-6727-5p、miR-6088、miR-4674、miR-8073、miR-4787-5p、miR-1469、miR-125a-3p、miR-885-3p、miR-6802-5p、miR-328-5p、miR-6787-5p、miR-8069、miR-6875-5p、miR-1246、miR-4734、miR-6756-5p、miR-3665、miR-6821-5p、miR-6805-5p、miR-4728-5p、miR-6726-5p、miR-197-5p、miR-149-3p、miR-6850-5p、miR-4476、miR-6858-5p、miR-564、miR-4763-3p、miR-575、miR-6771-5p、miR-1231、miR-1908-3p、miR-150-3p、miR-3937、miR-887-3p、miR-3940-5p、miR-4741、miR-6808-5p、miR-6869-5p、miR-5090、miR-615-5p、miR-8072、miR-128-1-5p、miR-1238-5p、miR-365a-5p、miR-204-3p、miR-4492、miR-6785-5p、miR-6511a-5p、miR-4525、miR-1915-5p、miR-3180、miR-6879-5p、miR-1199-5p、miR-6746-5p、miR-711、miR-663b、miR-4707-3p、miR-6893-5p、miR-4675、miR-4638-5p、miR-4651、miR-6087、miR-4665-5p、miR-4758-5p、miR-6887-5p、miR-3620-5p、miR-1909-3p、miR-7641、miR-6724-5p、miR-1343-3p、miR-6780b-5p、miR-4484、miR-4690-5p、miR-4429、miR-1227-5p、miR-4725-3p、miR-6861-5p、miR-6812-5p、miR-3197、miR-8059、miR-3185、miR-4706、miR-4497、miR-3131、miR-6806-5p、miR-187-5p、miR-3180-3p、miR-6848-5p、miR-6820-5p、miR-6800-5p、miR-6717-5p、miR-6795-5p、miR-4632-5p、miR-6778-5p、miR-3663-3p、miR-4689、miR-211-3p、miR-6511b-5p、miR-4750-5p、miR-6126、miR-614、miR-7110-5p、miR-744-5p、miR-6769a-5p、miR-4792、miR-5787、miR-6798-5p、miR-6781-5p、miR-4419b、miR-4446-3p、miR-4259、miR-5572、miR-6075、miR-296-3p、miR-6891-5p、miR-4745-5p、miR-6775-5p、miR-6870-5p、miR-920、miR-4530、miR-6819-5p、miR-6825-5p、miR-7847-3p、miR-6131、miR-4433-3p、miR-1228-5p、miR-6743-5p、miR-1268a、miR-3917、miR-6786-5p、miR-3154、miR-638、miR-6741-5p、miR-6889-5p、miR-6840-3p、miR-6510-5p、miR-3188、miR-551b-5p、miR-5001-5p、miR-1268b、miR-7107-5p、miR-6824-5p、miR-6732-5p、miR-371a-5p、miR-6794-5p、miR-6779-5p、miR-4271、miR-5195-3p、miR-6762-5p、miR-939-5p、miR-1247-3p、miR-6777-5p、miR-6722-3p、miR-3656、miR-4688、miR-3195、miR-6766-5p、miR-4447、miR-4656、miR-7108-5p、miR-3191-3p、miR-1273g-3p、miR-4463、miR-2861、miR-3196、miR-6877-5p、miR-3679-5p、miR-4442、miR-6789-5p、miR-6782-5p、miR-486-3p、miR-6085、miR-4746-3p、miR-619-5p、miR-937-5p、miR-6803-5p、miR-4298、miR-4454、miR-4459、miR-7150、miR-6880-5p、miR-4449、miR-8063、miR-4695-5p、miR-6132、miR-6829-5p、miR-4486、miR-6805-3p、miR-6826-5p、miR-4508、miR-1343-5p、miR-7114-5p、miR-3622a-5p、miR-6765-5p、miR-7845-5p、miR-3960、miR-6749-5p、miR-1260b、miR-6799-5p、miR-4723-5p、miR-6784-5p、miR-5100、miR-6769b-5p、miR-1207-5p、miR-642a-3p、miR-4505、miR-4270、miR-6721-5p、miR-7111-5p、miR-6791-5p、miR-7109-5p、miR-4258、miR-6515-3p、miR-6851-5p、miR-6125、miR-4749-5p、miR-4726-5p、miR-4513、miR-6089、miR-6816-5p、miR-4466、miR-4488、miR-6752-5p、miR-4739、miR-760、miR-602、miR-423-5p、miR-92a-2-5p、miR-16-5p、miR-451a、miR-135a-3p、miR-486-5p、miR-4257、miR-92b-5p、miR-1915-3p、miR-718、miR-940、miR-296-5p、miR-23b-3p、miR-92a-3p、miR-658、miR-6842-5p、miR-6124、miR-6765-3p、miR-7106-5p、miR-4534、miR-92b-3p、miR-3135b、miR-4687-3p、miR-762、miR-3619-3p、miR-4467、miR-557、miR-1237-5p、miR-1908-5p、miR-4286、miR-6885-5p及びmiR-6763-5pからなる群から選択される少なくとも1つのポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸をさらに含む、請求項5又は6に記載のデバイス。
【請求項8】
前記核酸が、下記の(6)~(10)のいずれかに示すポリヌクレオチド又はその断片:
(6)配列番号1、3~19、21~28、30、31、33~109、111~235、851~856、及び236~269のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(7)(6)のポリヌクレオチド又はその断片の塩基配列において1又は2の塩基の欠失、置換、付加又は挿入を含むポリヌクレオチド又はその断片、
(8)修飾核酸及び/又は修飾ヌクレオチドを含む(6)又は(7)のポリヌクレオチド又はその断片、
(9)配列番号1、3~19、21~28、30、31、33~109、111~235、851~856、及び236~269のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、
及び
(10)前記(e)~(h)のいずれかのポリヌクレオチド又はその断片とハイストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
(e)配列番号1、3~19、21~28、30、31、33~109、111~235、851~856、及び236~269のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(f)(e)のポリヌクレオチド又はその断片の塩基配列において1又は2の塩基の欠失、置換、付加又は挿入を含むポリヌクレオチド又はその断片、
(g)修飾核酸及び/又は修飾ヌクレオチドを含む(e)又は(f)のポリヌクレオチド又はその断片、及び
(h)配列番号1、3~19、21~28、30、31、33~109、111~235、851~856、及び236~269のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列を含むポリヌクレオチド、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
からなる群から選択される、請求項7に記載のデバイス。
【請求項9】
請求項1~4のいずれか1項に記載のキット又は請求項5~8のいずれか1項に記載のデバイスを用いて、被験体の検体における各標的核酸の発現量を測定し、該測定された発現量を、同様に測定された健常体の対照発現量と比較して、健常体の各標的核酸の発現量に対する被験体の対応する標的核酸の発現量の多寡に基づいて被験体が乳がんに罹患していることをin vitroで評価するための乳がんの検出を補助する方法。
【請求項10】
前記被験体が、ヒトである、請求項9に記載の方法。
(【請求項11】以降は省略されています)

発明の詳細な説明【技術分野】
【0001】
本発明は、被験体において乳がんへの罹患の有無の検査のために使用される、特定のm
iRNAと特異的に結合可能な核酸を含む乳がんの検出用キット又はデバイス、及び当該
核酸を用いて当該miRNAの発現量を測定することを含む乳がんの検出方法に関する。
続きを表示(約 1,700 文字)【背景技術】
【0002】
乳房は母乳をつくる乳腺と、乳腺から分かれる小葉、小葉から分かれ乳汁を運ぶ乳管及
びそれらを支える脂肪などから構成される。乳がんの約90%は乳管から発生し、乳がん
の約5~10%は小葉から発生する(非特許文献1)。国立研究開発法人国立がん研究セ
ンターがん対策情報センターが開示する2011年の日本国内における部位別のがん死亡
率の統計によると、乳がんの死亡数は12,731人に上り、日本人女性14人に1人が
罹患するとされ、女性における罹患数が最も多いがん部位である。また、米国では、8人
に1人の割合で女性が乳がんを発症すると言われており、2014年の推定乳がん罹患者
数は232,670人にも上り、そのうち約40,000人が死亡するとされる(非特許
文献1)。
【0003】
乳がんの進行度は非特許文献2に定められており、腫瘍の大きさ、浸潤性、リンパ節転
移、遠隔転移などによってステージ0、IA、IB、IIA、IIB、IIIA、III
B、IIIC、IVに分類される。乳がんの5年相対生存率はがんの進行度に大きく依存
し、ステージ0及びステージ1では100%、ステージ2では93%、ステージ3では7
2%、ステージ4では22%と報告されている(非特許文献1)。したがって、乳がんを
早期に発見することは生存率の向上につながるため、早期発見を可能にする手段の提供が
強く切望されている。
【0004】
乳がんの治療は原則的には外科療法であるが、進行度や転移、全身状態、乳がんの分類
によって薬物療法や放射線療法が併用される。特に、ステージ1又は2の早期の乳がんで
は、放射線療法との併用で乳房温存療法が選択できる場合もある(非特許文献1)。
【0005】
非特許文献1によると、乳がんの1次検査には、視診、触診に加え、乳房専用のX線検
査であるマンモグラフィ、超音波(エコー)検査などの画像検査がある。1次検査で乳が
んが疑われる所見が出た場合には、2次検査として病変に針を刺して細胞や組織を採取し
顕微鏡で調べる病理検査を実施する。また病変の状態や広がりを調べるために、必要に応
じてCT、MRI、腹部超音波、骨シンチグラフィ、PETなどの画像検査も実施する。
【0006】
乳がん検出のための腫瘍マーカーには、例えば、CEA、CA-15-3、CA27-
29などが知られている。これらの血中腫瘍マーカーは、乳がんが骨や肝臓など他臓器へ
転移した場合に上昇することがあると報告されているが、患者によっては上昇しない人も
おり、その有用性は限定的であるとされる(非特許文献1)。
【0007】
研究段階ではあるが、特許文献1~4に示されるように、血液をはじめとする生体サン
プル中のマイクロRNA(miRNA)の発現量、又はmiRNAの発現量と他のタンパ
ク質マーカーの発現量とを組み合わせることによって、乳がんを検出するという報告があ
る。
【0008】
具体的には、特許文献1には血液中のhsa-miR-602やhsa-miR-13
5a-3pを既知のタンパク質マーカーと組み合わせて前立腺がんや乳がんを含む他のが
んを検出する方法が示されている。
【0009】
特許文献2には血液や組織中のhsa-miR-23b-3pやhsa-miR-13
5a-3pを他の5個以上のmiRNAと組み合わせて乳がんを含む様々ながんを検出す
る方法が示されている。
【0010】
特許文献3には血球細胞中のhsa-miR-92a-3p、hsa-miR-92a
-2-5p、hsa-miR-92b-5pなどを用いて乳がんを検出する方法が示され
ている。
(【0011】以降は省略されています)

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